Село Средние Апочки расположено на берегу реки Апочка, являющейся левым притоком р. Оскол. Считается, что село получило своё название от реки, но существуют и другие версии этого названия. Слово «апочка» происходит от глагола «апочивать», т. е.отдыхать. Известно, что на месте нынешнего села было первое поселение людей по верхнему и среднему течению реки Оскол, где люди зимой отдыхали от летнего кочевья. Итак , первая версия- Апочка- место отдыха.
По другой версии «опока»- камень, т.к. у истоков реки есть меловые отложения довольно богатые крупными меловыми камнями, которые издавна применялись в строительстве жилья и хозяйственных построек местным населением.
Более правдоподобной можно считать третью версию. В «Энциклопедии географических терминов» слово «апочка»- быстрина. По долине реки много родников ,некоторые из них назывались «громовыми». Люди шедшие из крепости на р. Оскол, встретившись с быстрым течением в устье реки называли его «быстриной» или «апочкой».